Gaz halinde taşınan hidrojen, düşük yoğunluk ve yüksek patlama riski nedeniyle özel depolama ve nakliye gereksinimleri taşır. Hidrojen, genellikle yüksek basınçlı tanklar veya sıvılaştırılmış formda özel kriyojenik tankerler kullanılarak taşınır. Boru hatları da kısa mesafeler için etkili bir taşıma yöntemidir, ancak bu sistemlerin kurulumu maliyetlidir. Taşımada güvenlik önlemleri hayati öneme sahiptir; sızdırmaz bağlantılar ve sürekli izleme sistemleri kullanılır. Hidrojen taşıma teknolojilerinin gelişmesi, temiz enerjiye geçiş sürecinde kritik bir rol oynayacaktır.